До 2020 года военная подготовка студентов проводилась на военной кафедре университета. В 2020 году военная кафедра преобразована в Военный учебный центр НИЯУ МИФИ (ВУЦ НИЯУ МИФИ).
В настоящее время Военный учебный центр НИЯУ МИФИ активно участвует во всех проектах Минобороны России, адресованных студенчеству.
Основные направления деятельности ВУЦ НИЯУ МИФИ:
- подготовка офицеров запаса по высокотехнологичным (требующим высокого уровня базовой инженерной подготовки) военно-учетным специальностям, родственным гражданским специальностям и направлениям подготовки в университете;
- подготовка солдат и сержантов запаса;
- набор выпускников в научные роты, созданные Министерством обороны РФ.
Военный учебный центр университета во взаимодействии с Минобороны России дает возможность выпускникам НИЯУ МИФИ для продолжения научной карьеры добровольно поступить на воинские и гражданские должности в научно-исследовательские учреждения МО РФ.
Выпускникам НИЯУ МИФИ, завершившим обучение в Военном учебном центре университета, присваивается воинское звание, и они зачисляются в запас Вооруженных Сил РФ.